Rapport Année : 2024

Projet Inva-Biomonitoring Développement de méthodes de biomonitoring pour le suivi des espèces invasives en lacs

Résumé

This report presents the results of a study comparing different methods for detecting the round goby, an invasive species, in lakes. The study developed and validated an environmental DNA (eDNA) method using droplet digital PCR (ddPCR) and compared it to traditional methods of visual counting and electrofishing. The results show that the eDNA method is more sensitive, allowing better detection of the species, especially in newly colonized areas. It has several advantages: non-invasive, quick, easy to implement, and applicable in various aquatic zones. However, it does not provide immediate on-site information or details about size, sex, or maturity of individuals. Traditional methods, although less sensitive, offer complementary information but have their own limitations, such as the invasiveness of electrofishing or the subjectivity of visual observations.
Ce rapport présente les résultats d'une étude comparant différentes méthodes de détection du gobie à tache noire, une espèce invasive, dans les lacs. L'étude a développé et validé une méthode basée sur l'ADN environnemental (ADNe) utilisant la PCR digitale en gouttelettes (ddPCR), et l'a comparée aux méthodes traditionnelles de comptage visuel et de pêche électrique. Les résultats montrent que la méthode ADNe est plus sensible, permettant une meilleure détection de l'espèce, notamment dans les zones nouvellement colonisées. Elle présente plusieurs avantages : non-invasive, rapide, facile à mettre en œuvre, et applicable dans diverses zones aquatiques. Cependant, elle ne fournit pas d'informations immédiates sur le terrain ni de détails sur la taille, le sexe ou la maturité des individus. Les méthodes traditionnelles, bien que moins sensibles, offrent des informations complémentaires mais présentent leurs propres limites, comme l'invasivité de la pêche électrique ou la subjectivité des observations visuelles.
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Inva-biomonitoring-livrable 4 - Suivi ADNe du gobie à taches noires 2023.pdf (2.46 Mo) Télécharger le fichier
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Dates et versions

hal-04888364 , version 1 (15-01-2025)

Identifiants

  • HAL Id : hal-04888364 , version 1

Citer

Marine Vautier, Julien Dublon, Isabelle Domaizon. Projet Inva-Biomonitoring Développement de méthodes de biomonitoring pour le suivi des espèces invasives en lacs. INRAE - CARRTEL; ECLA. 2024. ⟨hal-04888364⟩
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